Integrative mikrobielle Genomik

Unsere Forschung

Wir wollen die Leistungsfähigkeit von Multi-Omic-Techniken nutzen, um das genetische Potenzial natürlicher mikrobieller Gemeinschaften zu entschlüsseln und es mit beobachteten Aktivitäten und Phänotypen zu verknüpfen. Unser Ziel ist es, die Nische und das Vorkommen diskreter Populationen in natürlichen Systemen vorherzusagen (z. B. während Phytoplanktonblüten) und die Diversität mikrobieller Populationen zu untersuchen (z. B. in der Natur oder auf Einzelzellniveau).

Mit Hilfe modernster, massiver Sequenzierungsansätze untersuchen wir mikrobielle Gemeinschaften, indem wir Nukleotidinformationen, die in DNA-Fragmenten ganzer Gemeinschaften gespeichert sind, untersuchen, um auf die taxonomische Zugehörigkeit und den Metabolismus zu schließen, und wir nutzen diese Informationen, um proteomische Profile zu untersuchen, um ihren aktiven Metabolismus zu verstehen. Zusätzlich generieren wir Nukleotid-basierte Markierungen, um diese mikrobiellen Gemeinschaften mit mikroskopischen Identifikationsansätzen zu visualisieren.

Unser aktuelles Projekt konzentriert sich auf natürliche Oberflächenwasserpopulationen aus der Nordsee, die in verschiedenen Porengrößenfraktionen erfasst wurden. Zukünftige Projekte werden die Erforschung von Sedimenten und deren Potenzial für den Abbau organischer Stoffe beinhalten.