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Forschungsgruppe Metabolische Interaktionen

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Our lab studies metabolic interactions between microbes and marine organisms living in symbiosis. We are using modern mass-spectrometry methods to understand which molecules are involved in host-microbe systems, how different metabolites shape the community and also how the symbiotic partner respond metabolically to environmental changes.

The research in his lab is constantly driven by method developments like high-resolution mass-spectrometry imaging to reveal the spatial metabolome of microbial systems. Our expertise is microbial metabolomics with a special focus on marine systems.

Research Group Metabolic Interactions 2021
Research Group Metabolic Interactions 2021

Gruppenleiter

Dr. Manuel Liebeke

MPI for Marine Microbiology
Celsiusstr. 1
D-28359 Bremen
Germany

Raum: 

3244

Telefon: 

+49 421 2028-8220

Dr. Manuel Liebeke

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Sea4Society Project is Underway

27.08.2021

In­no­va­ti­ve und ge­sell­schaft­lich ak­zep­tier­te An­sät­ze ent­wi­ckeln, um das na­tür­li­che Po­ten­zi­al für Koh­len­stoffspei­che­rung in ve­ge­ta­ti­ons­rei­chen Küs­te­nöko­sys­te­men zu ver­bes­sern: So lau­tet das Ziel des neu­en For­schungs­ver­bundssea4soCiety, an dem das Bre­mer Ma...

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Eine neue laserbasierte Ionenquelle wurde installiert

23.07.2021

Eine neue laserbasierte Ionenquelle wurde im Labor der Arbeitsgruppe „Metabolische Interaktionen” installiert. Mit der brandneuen AP-SMALDI-5AF können wir die räumliche Auflösung unser bildgebenden Massenspektrometrie Messungen auf 5 µm verdoppeln. Zusätzlich können wir die Messgeschwindigkeit un...

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3D CHEMHIST Paper Published in PNAS

06.07.2021

Correlative chemical imaging in symbiosis: Our workflow, combining mass spectrometry imaging and microCT in a multimodal 3D atlas of a symbiotic invertebrate is now online in PNAS, Congrats Benedikt!

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mass2adduct paper published in Analytical Chemistry

07.06.2021

The mass2adduct paper, which describes a method for identifying adducts in mass-spec imaging data, was recently published. Congrats to the team consisting of Moritz Janda, Brandon KB Seah, Dennis Jakob, Janine Beckmann, Benedikt Geier, and Manuel Liebeke. Find out more at these links:

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Select Publications

Geier BOetjen JRuth Steiner BPolikarpov M, Gruber-Vodicka HR, Liebeke M2021. Connecting structure and function from organisms to molecules in small-animal symbioses through chemo-histo-tomography. PNAS. 118 (27) e2023773118; 10.1073 / pnas.2023773118
Janda M, Seah BKB, Jakob D, Beckmann J, Geier B, and Liebeke M. 2021. Determination of Abundant Metabolite Matrix Adducts Illuminates the Dark Metabolome of MALDI-Mass Spectrometry Imaging Datasets. Analytical Chemistry. 93 (24): 8399-8407. 10.1021 / acs.analchem.0c04720 
Geier, B., Sogin, E., Michellod, D., Janda, M., Kompauer, M., Spengler, B., Dubilier, N. & Liebeke M. 2020. Spatial metabolomics of in situ host - microbe interactions at the micrometer scale. Nature Microbiology. doi.org/10.1038/s41564-019-0664-6
Sogin EM, Puskás E, Dubilier N, Liebeke M. 2019. Marine Metabolomics: a method for nontargeted measurement of metabolites in seawater by gas chromatography - mass spectrometry. mSystems 4 (6): e00638-19. 10.1128 / mSystems.00638-19
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